Identificación de levaduras nativas asociadas al café, Coffea arabica, en Boquete, Panamá

López Vdovenko, Evangelina (2025) Identificación de levaduras nativas asociadas al café, Coffea arabica, en Boquete, Panamá. Masters thesis, Universidad de Panamá. Vicerrectoría de Investigación y Postgrado.

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Abstract

Los granos de café para consumo requieren procesos post-cosecha, algunos de los cuales implican fermentación. No obstante, históricamente la fermentación del café se ha llevado a cabo con poco conocimiento sobre la taxonomía de los microorganismos involucrados. El objetivo de este trabajo fue identificar levaduras nativas a partir de frutos maduros y procesos de café, Coffea arabica, en la localidad de Boquete, Panamá. Se realizó recolección de muestras de frutos de café completamente maduros a partir de un total de tres variedades de C. arabica: Caturra, Geisha y Catuai. Adicionalmente, en una de las fincas se identificaron levaduras al final de tres procesos de fermentación: café lavado, fermentación anaeróbica seca, y fermentación en un biorreactor. Se hicieron aislamientos de levaduras a partir de diluciones seriadas de las muestras sembradas en medio YEPG. Se realizó una caracterización morfológica de cada aislado basada en microscopía de contraste de interferencia diferencial (DIC) y las características de crecimiento de las colonias. A cada aislamiento de levadura se le realizó amplificación y secuenciación del locus ITS para identificación molecular a través de la comparación de secuencias contra cepas tipo en la base de datos GenbankÒ. Adicionalmente, a las muestras de frutos recién cosechados y del final de los procesos de fermentación se les hizo análisis de “metabarcoding” para identificar las levaduras y hongos filamentosos presentes por este método independiente de cultivo. Se obtuvieron treinta y un aislamientos de levaduras, los cuales fueron identificados de pertenecer a ocho géneros: Candida, Hanseniaspora, Papiliotrema, Pichia, Rhodotorula, Starmerella, Saccharomyces, y Wickerhamomyces. De estos géneros, Wickerhamomyces se aisló de los tres procesos evaluados, mientras que Pichia y Hanseniaspora se aislaron solo de la fermentación en saco y en biorreactor. El análisis de metabarcoding de frutos maduros y procesos de fermentación resultó en la identificación de los géneros Fusarium, Penicillium, Cladosporium, como los hongos filamentosos más dominantes mientras que levaduras de los géneros Papiliotrema, Wickeramomyces, Starmerella fueron detectadas dentro de los 20 géneros más abundantes. Este trabajo contribuye al uso potencial de levaduras nativas aisladas en procesos de fermentación del café.

Item Type:	Thesis (Masters)
Subjects:	Q Science > Q Science (General) Q Science > QR Microbiology S Agriculture > SB Plant culture
Depositing User:	Yovani Olmedo
Date Deposited:	01 Jun 2026 13:05
Last Modified:	01 Jun 2026 13:05
URI:	http://up-rid.up.ac.pa/id/eprint/11098

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