Metabarcoding de ADN ambiental del Gen Mitocondrial 12S ARNr para el análisis de composición y estructura de peces arrecifales del Pacífico de Panamá

Murillo Ortíz, Carlos (2025) Metabarcoding de ADN ambiental del Gen Mitocondrial 12S ARNr para el análisis de composición y estructura de peces arrecifales del Pacífico de Panamá. Diploma thesis, Universidad de Panamá.

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Abstract

Los arrecifes coralinos del Pacífico de Panamá albergan gran relevancia ecológica y diversidad biológica; sin embargo, estos enfrentan presiones crecientes por el cambio climático y condiciones oceanográficas cambiantes. Por lo que el monitoreo de las comunidades biológicas marinas requiere sistemas de cuantificación continuos y aplicables a gran escala. Como complemento a los métodos tradicionales, herramientas moleculares precisas y no invasivas como el ADN ambiental (environmental DNA, eDNA) permiten monitorear la diversidad biológica al identificar organismos a partir de material genético detectable en el agua. Aquí aplicamos eDNA Metabarcoding del gen mitocondrial 12S ARNr, utilizando cebadores universales MiFish-U y secuenciación masiva (Illumina), para analizar la diversidad y estructura comunitaria de peces de arrecifes coralinos del Parque Nacional Coiba y el Archipiélago de Las Perlas durante las estaciones secas y lluviosas de los años 2021 y 2022. Además, mediante el análisis bioinformático de DADA2, el cual modela y corrige errores de secuenciación para reconstruir secuencias biológicas exactas (ASV), logramos (i) identificar un total 1,294 ASV que revelaron una composición taxonómica de 144 géneros distribuidos en 74 familias, a la vez distribuidas en 38 órdenes de peces óseos y cartilaginosos, (i) captar variaciones estacionales en la riqueza de ASV, siendo mayor en la estación seca que la lluviosa, (iii) la estructura comunitaria de amplicones sugieren estar influenciadas por variaciones locales y estacionales. Estos hallazgos validan el eDNA Metabarcoding como una herramienta robusta y complementaria para el monitoreo de la ictiofauna, capaz de detectar variaciones en la estructura comunitaria vinculadas a dinámicas oceanográficas complejas, estableciendo así una línea base para comprender la resiliencia de los ecosistemas arrecifales y orientar estrategias de conservación ante la pérdida de biodiversidad global.

Item Type:	Thesis (Diploma)
Uncontrolled Keywords:	ADN ambiental (eDNA), Metabarcoding, MiFish-U, 12S ARNr, diversidad alfa, estructura comunitaria
Subjects:	Q Science > Q Science (General) Q Science > QH Natural history Q Science > QH Natural history > QH301 Biology Q Science > QH Natural history > QH426 Genetics
Depositing User:	Ana Rodríguez
Date Deposited:	08 Oct 2026 14:24
Last Modified:	08 Oct 2026 14:24
URI:	http://up-rid.up.ac.pa/id/eprint/11714

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