Patrones de diversidad genética y desarrollo de marcadores genéticos para la detección de ADN ambiental de especies de tilapia Oreochromis SP (Perciformes: Cichlidae) presentes en sistemas lénticos en la República de Panamá

Allard Guerra, Angélica Zulay (2018) Patrones de diversidad genética y desarrollo de marcadores genéticos para la detección de ADN ambiental de especies de tilapia Oreochromis SP (Perciformes: Cichlidae) presentes en sistemas lénticos en la República de Panamá. Masters thesis, Universidad de Panamá.

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Abstract

Las tilapias son peces tropicales originarios de África consideradas altamente invasoras, debido a su capacidad para adaptarse rápidamente a diversos ecosistemas acuáticos tanto de agua dulce como salobre y con un amplio rango de tolerancia a temperaturas. La introducción de tilapias del género Oreochromis en sistemas lénticos de Panamá y en otros países de América Latina ha sido una práctica frecuente y se remonta a varias décadas. Además, es un problema que actualmente ocurre a nivel mundial, llevando a la pérdida de la biodiversidad en ecosistemas acuáticos. En esta investigación se utilizó una nueva técnica molecular para la detección de especies invasoras sin necesidad de captura. La detección se realizó mediante la amplificación de fragmentos de ADN mitocondrial especie-específicos a partir de ADN ambiental. Se determinó la diversidad genética de dos poblaciones de Oreochromis niloticus mediante la amplificación del gen Citocromo Oxidasa I. Los resultados mostraron una baja diversidad genética (π=0.00010, Hd=0.059), indicando que probablemente las poblaciones pasaron por un efecto fundador y un cuello de botella. Se obtuvieron además valores bajos de diferenciación genética (Fst=0.07), lo cual sugiere que podría tratarse de una sola población. A partir de las secuencias de ADN obtenidas de esta especie, se diseñó una sonda interna (TaqMan) y dos cebadores especieespecíficos para la detección de ADN ambiental mediante PCR en tiempo real. Se logró la detección del ADN ambiental de muestras obtenidas mediante ensayos controlados a diferentes densidades (1, 3 y 6 individuos/tanque), cuya detección mínima para esta especie fue de 0.0025 ng/μL de ADN. Tal como se esperaba, a mayor densidad la detección se realizó en menos ciclos de amplificación. Además, se realizó una prueba de persistencia, la cual indicó que el ADN ambiental puede ser detectado hasta siete días después que los individuos fueron extraídos de los acuarios. Se demostró que el uso de la técnica de ADN ambiental para la detección de O. niloticus es eficaz y sensible. Por lo tanto, se considera este estudio como piloto para la detección temprana y monitoreo de especies invasoras presentes en sistemas lénticos de la República de Panamá.

Item Type: Thesis (Masters)
Uncontrolled Keywords: Diversidad genética, Citocromo Oxidasa I, Oreochromis niloticus, ADN ambiental, PCR en tiempo real, sonda de detección.
Subjects: Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Depositing User: Denia Ramos
Date Deposited: 19 Jul 2019 20:36
Last Modified: 19 Jul 2019 20:36
URI: http://up-rid.up.ac.pa/id/eprint/1426

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