Caracterización molecular de cepas de Escherichia coli aisladas de muestras fecales y de aguas mediante ERIC-PCR y análisis del perfil plasmídico

Núñez Bósquez, Flor Marina (2017) Caracterización molecular de cepas de Escherichia coli aisladas de muestras fecales y de aguas mediante ERIC-PCR y análisis del perfil plasmídico. Masters thesis, Universidad de Panamá.

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Abstract

La E. coli tradicionalmente ha sido utilizada como un indicador de contaminación fecal en aguas y alimentos. Los avances en métodos de genotipificación de ADN y perfiles de resistencia a antibióticos han resultado de gran utilidad para la caracterización de aislados de E. coli con respecto a la fuente hospedera. La ERIC-PCR (enterobacterial repetitive ¡ntergenic consensus) es una técnica utilizada para la genotipificación de muchas bacterias ambientales y patógenas. Los objetivos de este estudio fueron el de determinar, por la técnica de ERIC-PCR, si existe o no clonalidad entre 117 cepas de E. coli aisladas de tres comunidades (Ciudad del Niño, El Arado y Escobal) y cinco fuentes diferentes (heces de gallinas, cerdos, vacas y humanos, y de aguas), y determinar la presencia de plásmidos en 112 de éstas cepas por aislamiento de ácidos nucleicos. Los resultados de la genotipificación indicaron que las cepas de E. coli ambientales y comensales mostraron una elevada diversidad de perfiles ERIC. Las cepas de E. coli que se aislaron de un mismo individuo o fuente mostraron diferentes patrones de bandas en el ERIC, al igual que las cepas que se aislaron de las diferentes comunidades. El 70.5% de las cepas de E. coli evaluadas resultaron positivas para ADN plasmídico. La prevalencia de plásmidos fue de un 44.3% en la comunidad de Ciudad del Niño, 31.6% en la comunidad de Escobal y 24.1% en la comunidad de El Arado. En conclusión, se encontró mucha heterogeneidad entre las cepas de E. coli aisladas de individuos diferentes y entre las comunidades. Esto podría indicar que las cepas de E. coli se están movilizando entre las comunidades de la zona y que estas cepas tienen orígenes diversos.

Item Type:	Thesis (Masters)
Subjects:	Q Science > QR Microbiology Q Science > QR Microbiology > QR355 Virology
Depositing User:	Lisbeth Amaya
Date Deposited:	14 Aug 2019 15:30
Last Modified:	14 Aug 2019 15:30
URI:	http://up-rid.up.ac.pa/id/eprint/1549

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